يحتل موضوع مراقبة نوعية مياه الشرب والمياه المستصلحة موقع الصدارة على سلم أولويات الشركة، حيث تطبق الشركة برنامج رقابي شامل معد وفقاً لمتطلبات المواصفات القياسية الأردنية الخاصة بمياه الشرب والمياه المستصلحة، والذي تجري الشركة من خلاله مختلف أنواع الفحوصات المخبرية بشكل دوري وعلى مدار العام على عينات يتم جمعها من مختلف مراحل الإنتاج، سواءً كان ذلك من محطات التنقية التابعة لها أو من محطتي تحلية مياه الشرب في كل من قطر والريشة أو من مصادر مياه محافظة العقبة أوشبكات التوزيع في كافة أنحاء المحافظة.

تجري الشركة هذه الفحوصات في مختبراتها التابعة لمديرية المختبرات والنوعية في محطة التنقية ومختبرها الميداني، بالإضافة إلى مختبرات سلطة المياه وسلطة منطقة العقبة الإقتصادية الخاصة.
لإن مياه حوض الديسة ذات مواصفات عالية مطابقة للمواصفات الأردنية والعالمية فإنها لاتخضع لإي معالجات إضافية لتصبح صالحة للشرب بإستثناء إضافة مادة الكلورين المعقمة.

نفخر هنا في شركة مياه العقبة أن بمقدور المواطنين في كافة أنحاء المحافظة شرب ما ننتجه من مياه مباشرة من الشبكة الواصلة لمنازلهم.